Per mitjà d’aquest decret l’IMLC adapta la seva organització territorial a la del Departament de Justícia i a la de la Generalitat, amb l’establiment de noves divisions territorials i àrees més àmplies que els partits judicials per oferir una millor prestació del servei.

Concretament l’Institut s’estructura en set divisions territorials: Barcelona Ciutat i l’Hospitalet de Llobregat, Barcelona Sud, Barcelona Nord i Catalunya Central, Girona, Lleida, Tarragona i Terres de l’Ebre.

El nou reglament reorganitza el servei de patologia forense amb l’establiment de centres de patologia forense que concentren els mitjans i els recursos més avançats en aquest àmbit i on es pot centralitzar la pràctica de les autòpsies judicials.

Els centres de patologia forense compten amb els mitjans i recursos més avançats en aquest  àmbit. El Centre de Patologia Forense de Ciutat de la Justícia de Barcelona i l’Hospitalet de Llobregat actuarà com a centre de referència de tots els centres de patologia de l’Institut.

Es crea el Servei de Documentació forense que organitzarà i supervisarà el treball d’emmagatzematge, arxiu i recuperació de dades, mostres, o qualsevol tipus d’informació inherent a les proves judicials generades a l’Institut  i informació de les proves pericials generades al servei de l’Institut. Aquest serveix garantirà  la protecció de dades de caràcter personal.

Es crearà també la Secció de Formació, Docència i Recerca Forense, que elaborarà el programa anual de formació i els programes de recerca i desenvolupament de l’Institut. Aquesta àrea es coordinarà amb la unitat docent MIR.